科目代码 | 875 | 科目名称 | 生物信息学 | ||
一、考试内容范围 | |||||
生物信息学是一门综合交叉学科,是采用信息科学、计算机科学和数学等学科的观点和方法对生命的现象及其组成分子(核酸、蛋白质等)进行研究,主要研究生命中的本质和规律,包括物质组成、结构功能、生命体的能量和信息交换传递等。 知识结构: ★ 生物信息学概论和数据库 ★ 序列数据的收集和存储 ★ 基因组序列组装和基因注释 ★ 基因结构元件识别和分析 ★ 双序列与多序列比对 ★ 数据库检索算法 ★ 序列变异研究的算法与进化分析 ★ 基因表达与调控网络 ★ 表观遗传学数据分析 ★ 蛋白质分类与结构预测 考核内容: 了解生物信息学概念、研究方向和发展趋势,并熟悉重要的生物信息中心和常用数据库。 了解不同类型序列数据的获取方式,掌握常用的序列存储格式及转换方式。 掌握常用序列联配算法,了解打分矩阵及空位罚分算法,并理解多重序列比对与进化分析的关系。 理解进化分析与亲缘树的关系,掌握三种进化分析算法(最大似然法、距离法和最大简约法)。 掌握转录组分析基本方法,理解基因表达差异分析的算法。 了解染色质免疫共沉淀技术,掌握ChIP-Seq数据处理流程和下游分析流程。 掌握蛋白质结构的组成和层次,理解序列相似性与结构相似性同蛋白质分类之间的关系,掌握蛋白质结构预测方法,包括二级结构和三级结构。 | |||||
二、试卷结构 | |||||
试卷满分150分。序列分析算法、数据库搜索工具、进化分析原理约占80分左右,新一代测序数据分析、表观遗传及相关生物信息学工具和分析等约占70分。
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三、参考书目 | |||||
作者 | 书名 | 出版社 | 出版时间 | 版次 | 备注 |
陈铭 | 生物信息学 | 科学出版社 | 2018年09月 | 第三版 |
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